C’est à travers l'enseignement de la musique au secondaire que Sébastien commence son parcours comme chef d’orchestre. Il occupa plusieurs rôles au sein du département de musique du Collège Notre-Dame de 2005 à 2020, notamment à titre de directeur musical. 

En 2018, il crée avec d’anciens élèves du Collège Notre-Dame, l’Orchestre à Vents Coda. Toujours dans cette même année, Sébastien devient directeur musical de la Symphonie des Vents de Montréal. Il est aussi directeur musical de l’Orchestre à Vents du Suroît, depuis 2019. 

Il est également membre des conseils d’administration de la Fédération des harmonies et orchestres symphoniques du Québec, du Festival des harmonies et orchestres symphoniques du Québec et du Concours Solistes et petits ensembles.